植物病理与植物 - 微生物生物学项目

以下是计划为夏季研究学者计划的项目的例子。有关2022个项目的详细信息,请在将来退房。

1.打败它!

尾孢属beticola,Cercospora叶斑病(CLS)的因果剂是美国表和甜菜的最具破坏性的叶面,真菌病原体之一,并对种植者的产量和生产力导致大幅度损失。引起疾病尾孢属物种还产生一种叫做植物孢菌素的植物毒素,并且对其合成的基因簇具有很好的表征。如果您喜欢甜菜,请在发现的航行中加入我们,以评估调节致病性的遗传c . beticola。额外的奖励将是参观现场的疾病,了解其影响和可用于餐桌甜菜种植者的管理方案。”

  • 领域:20%,实验室:80%(即将推出)
  • 学院:Pethybridge.

2.无甜菜真菌?Rhizoctonia solani.和表甜菜生产

纽约是全国第二大桌甜菜生产国(Beta寻常魅力SSP。vulgaris.)。最近的行业扩张增加了对可持续疾病管理策略的需求,特别是由根腐腐烂引起的Rhizoctonia solani.r .以上是表甜菜,甜菜和许多其他蔬菜和谷物作物的产量限制病原体。在甜菜中,目前的控制选项仅限于氮杂毒剂杀菌剂的沟中的沟中应用。夏季学者将在实验室和现场工作,以调查替代疾病管理策略,包括生物控制/生物融合。通过吻合组测定和人口研究将开发额外技能和表征分离物。

  • 领域:50%,实验室:50%,
  • 学院:Pethybridge.

3.太阳下面的东西?

我们的计划已经开创了使用紫外线来抑制植物疾病。(查看视频)。一个关键问题是处理对处理植物上的非目标生物有什么影响。是否受到了伤害,如果是,是哪些?在接受治疗性紫外线治疗后,酵母菌和细菌的数量会反弹吗?那需要多长时间?你将是世界上第一个回答这些问题的人。

  • 实验室:50%,场地:50%
  • 学院:Gadoury

4.果园着火了!

火焰枯萎,由细菌病原体引起Erwinia Amylovora.,是全球苹果生产最具破坏性的疾病之一,能够在美国未被预见的流行病中摧毁整个果园,每年在美国数百万美元。现代化的火灾枯萎症几乎完全依赖于抗生素喷雾剂,例如链霉素,由于病原体和偏离目标细菌种群的抗菌性抗性潜在的抗菌性潜在潜在的潜在发育。每年都有许多生物控制选项,用于管理火灾枯萎,但它们通常提供糟糕的控制,并且不优化温带生产区域。学者将研究替代管理计划,包括植物增长监管机构和生物控制,用于管理火灾。此外,学者还将调查分布和流动E. Amylovora.菌株和利用CRISPR基因分型技术管理的潜在影响。学者们将有机会参观实际的火灾爆发和了解现代苹果生产。

  • 实验室:50%,场地:50%
  • 学院考克斯

濒临灭绝的苹果!

苹果痂由真菌引起的Venturia Inaequalis.限制了温带气候下苹果的可持续生产。这种病原体已经对许多最安全、对环境最敏感的杀菌剂产生了抗药性。耐多药V. Inaequalis.在美国东部美国东部苹果行业的苹果生产业务中造成了灾难性的生产失败。学者将确定农业管理措施如何影响抗性人口的演变V. Inaequalis.为了帮助种植者可以安全和可持续地生产无病的苹果。他们将看杀菌靶位基因和微观生长的人口变化。此外,学者还将有机会访问果园的疾病爆发,并了解现代苹果制作。

  • 实验室:50%,场地:50%
  • 学院考克斯

6.霉菌使命

苹果粉状霉菌(Podosphaera leucotricha)是在世界上大多数苹果生长地区发现的真菌疾病。p . leucotricha随着苹果树在春天破坏休眠,减少树木活力和障碍开发的新增长。病原体是迫使(意味着它需要其宿主生存),这使得研究变得困难。从历史上看,p . leucotricha果园中的管理依赖于狭窄的杀菌剂,以维持控制。很少有人知道是否p . leucotricha群体对这些化合物产生了抗性。学者将有助于发展一个体外培养的方法p . leucotricha以便进行研究,并建立一种分离叶杀菌剂试验,以测试真菌分离株对杀菌剂的相对抗性。学者们还将学习DNA提取、PCR和序列分析方案,以评估已知的菌株对常用杀菌剂的抗性突变。此外,学者们将有机会参观研究和商业果园,了解现代苹果生产。

  • 实验室:80%,场地:20%
  • 学院考克斯

7.不要让他们的大小欺骗你......

尽管病毒的基因组很小且缺乏细胞机制,但它们仍然具有巨大的影响力:感染病毒的植物会表现出一系列症状,从叶子变色到果实变形或死亡。您将学习如何使用基因工程的葡萄扇叶病毒来研究植物病毒如何在其宿主引起症状。您还将使用蛋白质组学技术来探索蛋白质-蛋白质相互作用的症状发展的基础。您将获得分子生物学、植物病毒生物学、诊断病毒感染以及蛋白质提取、检测和蛋白质组学分析方面的技能。

  • 实验室:90%,温室:10%
  • 学院福克斯

8.一个病毒的ARM比赛与寄主防御

RNA沉默在植物抵抗病毒中起着关键作用。为了通过RNA沉默避免抗病毒宿主防御,植物病毒已经进化了RNA沉默抑制器,这些抑制器在植物和入侵病毒之间的臂上有效的臂。研究将涉及使用细胞,生物化学,遗传和分子技术的葡萄粉丝病毒的RNA沉默抑制剂的表征,以改善我们对植物病毒相互作用的基本知识,并解开该病毒抑制RNA沉默的机制。

9.葡萄和病毒和昆虫和共生:哦,我!

红色污染是最近公认的葡萄病毒疾病,其是由名为葡萄红色斑点病毒的DNA病毒引起的。该病毒由三角苜蓿料斗传输。关于宿主,病毒,Treehopper载体和Treehopper内的共生细菌之间的多技能相互作用有很多东西。您将使用核酸提取,聚合酶链反应,解剖和共聚焦显微镜等技术,以解决有关病毒传播和昆虫生物学的问题。您将在设计,优化和实施实验中进行积极的作用,以及分析和呈现数据。

10.红色代码:当病毒攻击!

葡萄红色斑点病毒是最近鉴定的葡萄牙红斑病疾病的因果试剂。这种病毒由葡萄园的三角苜蓿料斗矢量。您将有助于研究旨在通过其向量,葡萄和替代主机开发病毒的高效传输测定,以帮助表征传输模式。您将使用植物接种与传染性病毒克隆,核酸提取,聚合酶链反应,解剖,测序和显微镜等技术进行设计和优化测定,同时学习昆虫饲养技术。

  • 实验室:70%,温室:30%
  • 学院:福克斯

11.没有勇气,就没有荣耀!

三角苜蓿料斗载体是一个名为葡萄红色斑点病毒的DNA病毒。关于该病毒发射器的景观级运动很少;然而,虽然葡萄不是生殖宿主,但跳跃者在短暂的夏季,跳跃者只能在葡萄园中发现。该项目将介绍分子肠道内容分析的优化,以解决葡萄园生态系统中Treehoppers的喂养偏好。研究将涉及昆虫饲养,喂养试验,解剖,分子膳食组合物,PCR,测序等实验室技术,揭示病毒 - 载体宿主相互作用。

  • 实验室:70%,温室:30%
  • 学院:福克斯

12.与现代武器的旧战斗:我们可以用下一个基因组学击败火灾枯灭吗?

火焰枯萎,由革兰氏阴性细菌引起Erwinia Amylovora.,是苹果树最具破坏性细菌疾病之一。近年来,由于吞吐量技术增加和基因组测序成本的降低,研究已经彻底改变了。您将参与一个项目,该项目利用高通量基因组学和表情,以更好地了解宿主病原体互动。利用这些信息,我们可以在纽约州日内瓦,纽约州的美国Apple种质存储库中获得的遗传多样性来表征苹果中的自然阻力来源,鉴定基因组区域(QTLS),分子标记和底层基因。您将在温室中接种苹果树,以确定对火灾的易感性,然后参与绘制遗传抵抗源。此外,您将使用叶绿素荧光,红外线热和多光谱成像来检测早期症状,以响应火灾感染,并量化疾病易感性/抵抗力。该研究的结果最终将用于通过在商业上有利的背景下展开阻力等待物来遗传增强苹果中的火焰抗烈抗性。

  • 实验室:50%,温室:50%
  • 学院

13.可以在苹果园准确诊断疾病的机器吗?

Apple Orchards患有大量疾病,可能会对树木,水果和行业产生严重损害。快速准确的疾病诊断对于商业苹果园至关重要,以及时控制,并实施成功和环境健全的管理。疾病的出现症状可以根据图像捕获条件或宿主和疾病的特征而变化,使得计算机视觉模型的挑战是挑战,以准确区分许多疾病的许多症状。高质量图像的大型数据集对于培训计算机视觉模型至关重要。您将通过在不断增长的季节期间使用数码相机和智能手机收集,注释和分类生物和非生物胁迫的高分辨率图像。该图像数据集将用于开发自动化图像的疾病分类和量化苹果的生物和非生物应激的症状,以加速和自动化的应力诊断和管理在苹果园。纽约康奈尔科技的学生将使用这些图像来开发和火车机器学习模型进行自动疾病检测,并且您将与他们合作以测试模型。

  • 计算机:50%温室:50%
  • 学院

14.吸引苹果的关键:Apple SCAB真菌人群多样性,毒力和宿主遗传性

Apple Scab,由此引起Venturia Inaequalis.,是全球主要苹果品种的破坏性疾病,其中大部分都适度易受影响。品种抗性是降低整体生产成本并保持果实质量的最佳长期解决方案。孤立的V. Inaequalis.几十年来,他们克服繁殖计划中使用的商业苹果品种中发现的抗性基因的能力。您将参与一个项目来表征真菌分离物的毒力和苹果结痂抗性的遗传学。这将涉及收集和文化V. Inaequalis.基于基因组重构数据的分离物及其系统发育分析。此外,该项目将需要人工接种和抗性/敏感性/敏感性/敏感性评估遗传映射人群和温室中的差分宿主,以及来自世界各地的苹果园中的苹果园中的现场数据收集。

  • 实验室:50%,温室:50%
  • 学院

15.细菌效应物在番茄侵染期间影响效果吗?

这是正确的!如果你能说出来,你肯定会喜欢努力。

植物病原体尽可能多地享受蔬菜。为了促进疾病,植物病原体使用一系列分子机制对他们的宿主。效果是病原体部署以操纵宿主代谢的蛋白质,从而支持自己的生长。在这个项目中,您将对几种菌株进行全基因组分析黄cynaraePV。加德纳利钓到推定效果。该方法将包括生物信息学,以对准基因组和实验室工作,以验证接种番茄叶中这些效应器的存在。

16.从根本上解决了我们的微生物问题

工业大麻是全国新兴经济作物,粮食和纤维生产范围无数用来对CBD补充剂。常见的土壤病原体如Fusarium SPP.。和Pythium spp.。当这些病原体渗透根系并防止射击时,是根腐肉和血管枯萎病的常见因果子。我们的目标是确定生物添加剂是否可以增加根系生长,并帮助Hemp幼苗逃避根腐的破坏性效果。在该项目中,您将学习从场样品中分离真菌病原体的技术,分析HEMP根生长与各种生物学添加,并使用无根电图软件收集成像数据。

  • 实验室:50%,温室:50%
  • 学院c .聪明

17.一勺糖有助于病原体下降!

葫芦作物易受各种真菌和oomycete病原体的影响,可以攻击其根,冠,叶子和水果。土壤中的病原体Phytophthora Capsici.它会导致寄主植物的所有部位发生枯萎病,这里我们对冬南瓜的果实腐烂尤其感兴趣,Cucurbita.sp。由于先天免疫,一些品种易受果实感染的影响,包括外皮厚度和糖含量。在这个项目中,您将调查糖可能的抑制作用P. Capsici.并学习从场样品中孤立病原体的技术。

  • 实验室:65%,温室:35%
  • 学院c .聪明

18.光,病原体,行动!

反射光谱是一种新建但高度有效的非破坏性评估植物病理学工具,可用于检测早期,甚至患有前症状的病原体感染。该项目将探讨具有非破坏性光谱法在现场葡萄粉的粉状霉菌和葡萄霜霉病的早期检测。通过这个项目,您将获得R的应用精密农业研究和数据分析技能。该项目将直接促进建立纽约州葡萄种植者早期疾病检测系统的更广泛努力。额外的奖金将是访问该领域中的疾病,了解其对葡萄种植者的影响和管理选择。

  • 领域:40%,计算:60%
  • 学院:金子

19.喷气病原体实验室:葡萄园疾病检测NASA传感器

喷气推进实验室的下一代机载可见和红外成像光谱仪(AVIRIS-NG)是地球上最高质量的成像光谱仪(又名高光谱成像仪)。该项目将与美国国家航空航天局(NASA)的AVIRIS-NG合作,探索商业葡萄园葡萄病害的早期检测。通过该项目,您将获得应用精确农业研究、高光谱成像、python数据分析以及在QGIS中使用遥感数据的技能。该项目将直接促进为美国葡萄种植者建立全球和区域疾病预警系统的更广泛努力。额外的奖励将包括虚拟访问和与NASA喷气推进实验室的科学家互动的机会,在这个项目上与黄金实验室合作。

  • 计算:100%
  • 学院:金子

20. Phytopatholobot:未来的童子军!

Phytopatholobot(PPB)是下一代葡萄园侦察兵:全神经和完全机器人!该项目将通过教导他如何区分葡萄剧本霉菌和白粉病,帮助发展PPB侦察疾病的能力。通过这个项目,您将获得精密农业研究,应用机器人,Python数据分析的技能和计算机视觉。该项目将直接促进为纽约州葡萄种植者建立早期疾病检测系统的更广泛。额外的奖金将是访问该领域的疾病,并与计算机科学家和工程师合作。

  • 领域:50%,计算:50%
  • 学院:金子

21. Hitchhikers注意到:在全球粉尘中监测土壤中的病原体运输

全球沙尘暴带来的不仅仅是尘土,越来越多的证据表明,它们也带来了土壤传播的植物病原体!该项目将研究病原体特性的改变如何影响尖孢镰刀菌在全球尘埃流中搭便车的能力。通过该项目,您将获得精准农业研究、生物信息学、python数据分析和QGIS遥感数据可视化等技能。该项目将直接促进更广泛的努力,为全球农业建立全球和区域疾病预警系统。额外的奖励将包括虚拟访问和与NASA喷气推进实验室的科学家互动的机会,在这个项目上与黄金实验室合作。

  • 计算:100%
  • 学院:金子