夏季学者绘制抗腐葡萄路径

安妮·雷普卡在葡萄园里
安妮·雷普卡'17在日内瓦康奈尔大学纽约州农业实验站的一个葡萄园里寻找黑腐菌的证据。图片来源:Elizabeth Takacs

阿曼达·加里斯2004年博士

在实习的最后一周,安妮·雷普卡(Anne Repka ' 17)设置了参数,按下启动键,在不到吃午饭的时间里,她整个夏天的实地工作就转化为一个具有统计学意义的基因组发现。她已经确定了染色体的几个区域,这些区域可以使葡萄容易受到真菌的感染,当浆果在藤蔓上成熟时,真菌会腐蚀浆果。

作为日内瓦夏季学者计划的一部分,雷普卡是在康奈尔大学纽约州农业实验站度过夏季的25名学生之一,他们研究的项目从大黄蜂授粉到植物病毒。该项目成立于2009年,向全国各地的顶尖本科生介绍农作物研究的严谨性。对于Repka来说,不需要这样的介绍;她主修植物学和葡萄栽培与葡萄酒学双学位,并计划辅修作物和土壤学。

Repka与博士后Elizabeth Takacs和综合植物科学学院的园艺和葡萄育种教授Bruce Reisch一起研究了由黑腐菌(Guignardia bidwellii)构成的葡萄园挑战。根据Reisch的说法,对于有机农民来说,使用已批准的处理方法来阻止其传播几乎是不可能的,因此在新的遗传标记的帮助下开发抗性品种是他育种计划的优先事项。

为了取得进展,Repka收集了两个种群的耐药性和易感性数据,用实验室培养的孢子接种正在发育的群集,并每隔三天检查疾病的进展。在实验结束时,收集这些集群,对症状进行评分并拍照。这些实地数据与Reisch实验室已经收集到的基因数据相结合,帮助他们确定了使葡萄更容易受影响的基因组区域。

雷普卡说:“实验布置得非常好,我们能够在夏天的很短时间内完成。”“这真的是一次很好的经历。”