Lori Huberman

丝状真菌的自助餐:了解营养传感的调控和转录景观

感知有效营养物质并有效利用它们是所有生物共同面临的挑战。腐生和植物病原真菌分解各种碳水化合物:从单糖到植物细胞壁中发现的复杂碳水化合物。此外，丝状真菌利用各种有机和无机氮源。调控这些相互关联的代谢途径的转录网络是转录激活因子和抑制因子的相互作用，确保只表达所需的基因，以利用最有利的营养物质。我们使用经典的遗传学和系统生物学工具来探索这个转录网络。

开发丝状真菌高通量功能基因组学平台

允许快速且廉价的全基因组测序的测序技术的进步突出了在功能性上有几个基因。这种问题在真菌生物学中急剧剧本，即使在最佳研究中的一半基因上的学习生物中也会被注释为假设。用于鉴定基因功能的高吞吐工具存在用于单细胞生物，例如酵母和细菌。然而，丝状真菌对高通量基因查夏出现了许多挑战。意大利风素柔性化，包括多核细胞和无性融合。我们目前正在努力克服这些挑战，并利用模型真菌神经孢子和扩展到植物病原体的丝状真菌，如曲霉属植物，为纤维素的真菌进行高通量功能基因组学耐药性氟糊精。为了将角色分配给新基因，我们正在制作具有数十万个唯一条形码的插入突变体的图书馆，并使用高通量测序映射这些条形码插入的位置。我们现在正在努力开发大规模平行的屏幕，从表型到基因型。量化相对条形码丰度将使我们确定在实验条件下破坏基因的相对重要性，并将功能分配给假设基因。在许多真菌系统中产生条形码插入诱变文库将能够快速表征基因功能，并使我们能够扩大我们对真菌生物学的理解。