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由于食品行业转向高分辨率,全基因组测序,世界的粮食供应将变得更加安全 - 这次审查给定生物体的全部DNA。这种举动使普遍存在的测序将导致持续可靠的沙门氏菌检测。

7月12日在微生物学期刊中发表的一篇文章 - 由康奈尔和火星全球食品安全中心(GFSC)的研究人员共同撰写 - 北京 - 照亮突破。

“沙门氏菌是全球最大的公共卫生和经济影响的食源性病原体。这是世界各地腹泻的主要原因之一,“食品安全和食品教授麦克特家族教授马丁维德曼康奈尔食品系统研究所教师。“沙门氏菌可以轻度或可能导致死亡,因为其严重程度取决于沙门氏菌的血清型[独特的变化] - 这就是我们想要了解的东西。”

本文描述了世界各地的食品行业如何使用分子方法来较常见的亚型和表征沙门氏菌。本文比较了较旧的亚型惯例 - 一些实践返回到20世纪30年代 - 到更新的全基因组测序,一种方法可以分析更广泛,更完整的基因组。

Wiedmann说,通过这种技术,科学家可以更精确地识别特定的沙门氏菌菌株并确定疾病爆发的起源和路径。

For example, in early July the U.S. Food and Drug Administration and the federal Centers for Disease Control and Prevention (CDC) used the technique, as they began investigating a suspected salmonella link between pig-ear dog treats and humans – due to people handling the treats. At the time, there were 45 cases of salmonella in 13 states, with 12 people hospitalized, according to the CDC.

“全基因组测序迅速成为沙门氏菌亚型的选择方法,”微生物学家硅汤,博士。'15,该论文的主要作者和火星全球食品安全中心的高级研究科学家。“食物经常通过越来越复杂的供应链到达消费者,从而创造了许多机会,食品安全可能会受到损害。最近的案例突出了加强食品工业中的沙门氏菌控制措施的需要,包括用适当的亚型工具快速准确地跟踪污染来源。“

唐说,食品行业有机会创造生物信息学的专业知识的人才管道 - 使用软件工具来了解生物数据 - 利用全基因组测序技术的全部潜力。

此外,Wiedmann表示,本文代表了学术分析转化为有用的行业申请。“这将有助于行业实施更好的方法来主动解决沙门氏菌的并发症和复杂性,”他说。

除了Wiedmann和Tang,合着者的“沙门氏菌分子亚型和表征方法的评估与比较“是Renato Orsi,高级研究员,康奈尔;和郝罗,崇涛,广涛张,罗伯特C.贝克和阿比盖尔史蒂文森的火星全球食品安全中心。该研究由火星中心资助。

本文也出现在康奈尔纪事中。

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