迈克·斯坎伦
综合植物科学植物生物学科教授
Mike Scanlon于1993年从爱荷华州立大学获得遗传学,并于1993-1997年是加州大学的NSF博士后研究员。迈克于1997年9月加入了格鲁吉亚大学植物生物系教师,并于2006年1月在康奈尔大学将其实验室转移到康奈尔大学植物生物学系。
兴趣
分生与叶发育机制
植物形态的进化
Arabidopsis,番茄,塞拉尼氏蛋白和Physcometella
最近的研究
Scanlon Lab的研究侧重于植物开发机制和植物形态的演变。利用比较发育遗传学和功能基因组学,我们对该过程特别感兴趣,由此分享到叶子和胚胎制作成分。我们的实验室利用玉米,拟南芥,番茄,塞拉涅氏蛋白和苔藓Physcomitralla作为植物开发中这些基本过程的比较研究的基础。
选定的日记出版物
- Li, X., Leiboff, S., Li, X., Hu, H., Todt, N., Yang, J., Li, X., Yu, X., Muehlbauer, G., Timmermans, M. C., Yu, J., Schnable, P. S., & Scanlon, M. J.(2015)。玉米射击顶端公司中文水表多样性的遗传控制。自然通信。
- Frank,M. H.,&Scanlon,M. J.(2015)。苔藓小立碗藓芽三维发育的细胞特异性转录组学分析。植物杂志。83:743-751。
- Frank, M. H., Edwards, M. B., Schultz, E. R., Fei, Z., Sorensen, I., Rose, J. K., & Scanlon, M. J.(2015)。从两个古老植物谱系中解剖到顶端细胞型芽分子的分子鉴定。新的植物学家。207:893-904。
- Johnston, R., Leiboff, S., & Scanlon, M. J.(2014)。玉米(Zea mays)叶鞘基部的个体发育。新植物学家。205:306 - 315。
- Johnston,R.,Wang,M.,Sun,Q.,Sylvester,A.W.,Hake,S.,&Scanlon,M. J.(2014)。转录组分析表明,玉米韧带发育概括了横向器官引发期间发生的基因表达模式。植物细胞。12月16日PII:TPC.114.132688。[epub领先]。
- Frank,M. H.,H.,Scanlon,M. J.(2014)。通过协调选择血管色素和孢子素遗传计划的孢子体 - 优势土壤植物中射击分发功能演变的转录组据证据。MBE:分子生物学和进化。
- Zhang, X., Dougal, R. N., Strabel, J., Lee, M., Buckner, B., Janick-Buckner, D., Schnable, P. S., Timmermans, M. C., & Scanlon, M. J.(2012)。斑点维管表达1是一种新的叶片模式基因,在玉米ta-siARF通路下游发挥作用。植物生理学,159:1453 - 1462。
- Takacs, E, Nettelton, D., Schnable, P. S., Muehlbauer, G. J., Yu, J., Timmermans, M. C., & Scanlon, M. J.(2012)。玉米茎顶分生组织的个体发育。《植物细胞》24:3219-3234。
- Woodward, J. B., Abeydeera, N. D., Paul, D., Phillips, K., Rapala-Kozik, M., Freeling, M., Begley, T. P., Ealick, S. E., McSteen, P., & Scanlon, M. J.(2010)。玉米硫胺素营养丰盈在拍摄公司维护方面有缺陷。《植物细胞》22:3305-3317。
- Ji,J.,Stramble,J.,Shimizu,R.,Koenig,D.,Sinha,N.,&Scanlon,M. J.(2010)。WOX4促进原形成层发育。植物生理学,152:1346 - 1356。
外展和延伸重点
Scanlon是关于一项新拨款的新授权,将培训杜鲁门州立大学(苏)的本科生,该议院,莫克斯维尔农村克尔克斯维尔的公共文艺制度,将进行玉米发育突变体的形态,表达和转录组分析。Co-Pi Timmermans的实验室将在第1年夏季举办8周的TSU本科,以在两种玉米发育突变体和非突变兄弟姐妹上进行LM-RNA喃咯。Co-Pi的Janick-Buckner和Buckner将花费一周前往Timmermans的实验室参加数据收集,并体验CSHL的许多丰富机会。Co-PI Buckner将参加1年内基因组数据的CSHL车间统计分析,以促进RNASEQ数据的处理和分析,并在这些技术中指示楚本生成。楚本科将每年在玉米遗传会议以及地方和区域会议上展示他们的数据。这些活动将在植物基因组学中将TSU Co-PI和本科生揭示到最先进的调查。Co-Pi欧文斯(康奈尔)将导致夏季Reu学生(1-3),他将研究玉米线的光合生理学,玉米线在阴影避免的形态方面表现出极端。此外,欧文斯工厂生理实验室课程中的本科生将参与使用体内叶绿素荧光监测的光合变化的筛选。
Scanlon是关于一个NSF授予的PI,提供了一个由合作司机领导的多媒体公共教育倡议来创建“杂草”的资金。David Micklos of Dolan Dna学习中心(DDLC)在寒春港实验室。“杂草奇迹”将展示玉米研究的连续性 - 从玉米生殖器,玉米遗传学家,植物生理学家和分子生物学家 - 在玉米基因组测序项目中有息息。与对玉米植物的演变的这种故事同时,“杂草想知道”也会讲述玉米对人类文化的影响。利用音频和视频格式的序列化播客,“杂草至奇迹”将提供对科学,技术和社会之间的互动的案例研究。多媒体内容将与DDLC开发的在线实验和生物信息学工具集成,并将与NSF资助的倡议IPLANT一起传播全国范围内。实际实验的连续性将允许中学,高中,并开始大学生从蛋白质遗传和生物信息分析到基因组结构和演化的检查,从核遗传和生物信息分析无缝进展。该项目处于第二年的发展年份,预计将于2011年初发布。
一。目标。
Scanlon实验室的外联活动的目标是双重组合:(1)促进现代植物生物学的毕业生和本科教育和研究培训,(2)促进现代植物生物学中的公共教育。
b.成就/外联活动
与杜鲁门州立大学合作:
在过去的七年中,PI Scanlon领导了玉米SAM项目,这是一个NSF植物基因组研究项目,包含了一个旨在传播对植物科学的理解和欣赏的大学生动手训练和教育项目。在此期间,30多名来自密苏里州科克斯维尔郊区人文学院杜鲁门州立大学的本科生在微阵列数据的注释、SAM数据库的创建和维护方面发挥了关键作用,并接受了遗传学、组织学、并对本项目产生的玉米突变体进行分子分析。杜鲁门大学的本科生参加所有的项目会议,并在每年的国际玉米遗传学会议上展示他们的数据。这些学生中,有12人的手稿获得了作者身份,20多人毕业于中山大学并正在攻读研究生学位。
研究培训外联活动:
Scanlon在UGA和康奈尔的任期期间训练了十五本科生在分子遗传学中进行实验室工作。Scanlon在UGA教授了一个课程“基因技术”,六年来毕业,本科生。两个生物学本科生就是在获得本课程后在Scanlon的实验室中获得研究经验,并在Scanlon的实验室中工作。Scanlon成为地理博士学位博士的共同顾问。D学生注册了基因技术,并培训了他进行濒危植物物种的SSR分析。这名学生发表的两篇论文中的所有分子遗传(现在是佛罗里达大西洋U.的助理教授)在普朗斯在UGA的实验室进行了。PI Scanlon作为NSF外展活动的一部分,在萨科的雪松萧山高中AP生物学教室提出研讨会;大约60%的学生们参加雪松萧条高中代表了科学中代表的少数群体。一名高中高中招募并在斯卡隆实验室兼职工作。2006年夏天,PI Scanlon的实验室举办了博士博士·赫萨尼奥廖洛博士两周,他训练在QRT-PCR和激光 - 微放映微阵列技术。Hacisalihoglo博士是佛罗里达A&M教授,该教授是佛罗里达州塔拉哈西的历史上黑人大学。 Also during summer 2006 and 2007, Scanlon hosted and trained High School student Eric Kelsey, who was recruited from Kennebunkport, ME High School by Cornell’s PGRP REU outreach program. Kelsey worked on a project to analyze evolution of the narrow sheath duplicated genes in the genus Zea. Cornell undergraduate Devon Van Noble, an African-American student interested in public health and environmental law, worked as a laboratory assistant in the Scanlon laboratory for two years. During summer 2007, undergraduate student Doug Eudy (Truman State U) spent 10 weeks in the Scanlon lab studying reverse genetics and in summer 2008 undergraduate student Samantha Wronski (SUNY Canton) worked as an REU student learning reverse genetics and plant developmental biology. During summer 2009, NSF REU student Eric Schultz of Northern Illinois University worked with graduate student Margaret Frank on histological analyses of shoot branching in Selaginella and targeted mutagenesis of WOX genes in Physcomitrella. Currently, Cornell undergraduate biology students Molly Edwards and Neiman Tan are being trained for research work in the Scanlon laboratory. Scanlon currently serves as Co-PI on grant for the Cornell REU program funded by NSF.
公共教育外展活动 - 杂草奇迹:
另一项由斯坎隆的NSF-PGRP SAM资助的拓展项目是公共教育合作项目,由大卫·米克罗斯博士领导,他是多兰DNA学习中心(DDLC)的主任,这是一个位于冷泉港的非营利性遗传学教育公共资源。Micklos开发了一个名为“杂草到奇迹”的多媒体网站,展示了玉米研究的连续性——从本地农业学家到农业育种家、玉米遗传学家、植物生理学家和分子生物学家——这已经达到了玉米基因组测序项目的高潮。在讲述人类对玉米进化的影响的同时,《野草到奇迹》也讲述了玉米对人类文化的影响。利用音频和视频格式的系列化播客,“Weed to Wonder”提供了一个科学、技术和社会之间互动的案例研究。为了期待2009年11月玉米基因组序列的公布,DNALC的一个摄像小组前往墨西哥记录研究背后的故事,并将基因组序列纳入玉米种植的历史背景中。这是播客“玉米的爆炸性起源”。此外,“玉米基因组测序”环节还包括描述美国和墨西哥团队使用的不同dna测序方法的循序渐进的动画,圣路易斯华盛顿大学基因组测序中心的视频参观,以及相关研究人员对该项目的评论。“杂草到奇迹”项目的另一项成果是1909年对CSHL的历史再现,George Shull解释了他的杂交活力实验,这是今天所有杂交玉米种植的基础。除了Shull的视频再创作,“杂交玉米的发展”还展示了Shull用杂交玉米做实验的动画,他的三篇原始研究论文,以及一个图像画廊。芭芭拉·麦克林托克的《世界》讲述了这位诺贝尔奖得主的生活,包括这位科学家的照片,以及她在CSHL实验室发现转座子(所谓的“跳跃基因”)的人工物品。 Two animations explain her work with transposons, and a downloadable PDF timeline of McClintock’s life and work is also available.
用于学生的实践实验包括两个DNANC开发的在线实验室笔记本。中学生的“孟德利亚遗产”通过探索人类和玉米的遗传性状来介绍曼德尔的法律。“检测玉米中的冬季冬季”,瞄准老年学生,研究了玉米的青铜(BZ)突变体,分析基因型和表型之间的分子关系。
截至2010年3月31日,Weed to Wonder网站的访问量为51475次,明显高于与CSHL研究人员合作开发的类似网站(同期Greenomes网站的访问量为10461次,Dynamic Gene网站的访问量为8,971次)。在接下来的一年里,我们的合作者将利用在墨西哥拍摄的镜头来发展更多关于玉米种植历史的故事,并预计将有更多的摄像之旅来捕捉玉米作为主要作物和研究模型发展故事的其他元素。
课程教授
生物基础课程目标。作为一门面向非生物科学专业学生的入门级生物课程,这门新设计的课程的目标是提供一个关于生物有机体在应对外在和内在挑战时所进化出的化学和细胞突现特性的概念性概述。重点将放在生理学、遗传学和发育生物学中定义生物的共享的战略概念上。作为生命科学专业的学生,另一个重要的目标是使学生能够向广泛的受众传达科学概念,并按照科学方法对生物实验的设计、执行、结论和结果进行批判性评估。
BIOPL2490好莱坞生物学 - 课程目标。作为一个非专业分销课程,该课程的重点是基本的生物学概念,使学生能够阅读和理解纽约时报科学时报,PBS计划新族或受欢迎的科学杂志科学美国科学杂志中提出的生物问题。本课程将继续审查流行电影背景中提出的生物概念,方法和理论及其文化和道德考虑因素。目前,在社会中,许多闪点生物学问题突出,包括干细胞研究,个人基因组数据,动物克隆,转基因生物和进化与“智能设计”。在未来几年中,围绕这些和其他生物概念循环的重要立法问题将被争论和决定。本课程将为学生提供现实生活中的最先进的科学的例子,使非科学家能够在日常生活和社会中对媒体面对的反对中的知情决策和解释。
BIOPL6410植物分子生物学课程目标实验室。作为介绍性实验室技术课程,旨在将进入的研究生引入现代植物分子生物学中的标准和最先进的技术。我将继续培训学生在激光微生物介导的定量实时PCR分析玉米芽分泌的基因表达,同时将它们引入可以应用激光微粉切除的研究应用范围。本课程的一部分重要部分是家庭作业,在作业中,要求学生创造性地解释他们在拍摄公司结构和功能方面获得的基因表达数据。
植物发育遗传学
植物分子生物学
非专业本科生物学
过去一年教授的课程:
1)BIOPL 2490好莱坞生物学:电影院生物科学。开发了2009年春季的新本科非专业生物学课程。目前在2010年春季正在进行
2)BIOPL 4831植物生物学的概念和技术(50%)。从前几年修改过课程。Scanlon与另外两位教师联系的团队在2008年秋季教授50%的讲座。2009年秋季,将课程扩大到全学期。
3)BIOPL 6410植物分子生物学实验室(7名教练中的1个)。在2006年秋季教授本课程的三个实验室会议,2007年,2008年,也在2009年秋季
2012年秋季为BIOG 1140生物学基础课程授课并准备讨论部分。189名学生中,100%
2012年春季教授BIOPL 2490好莱坞生物学课程,40名学生- 100%
- PLBIO 4220:比较植物发展:Evo-Devo
- PLBIO 7430:植物细胞和分子生物学学院研究
- PLBIO 7490:植物学研究生研究
- PLSCI 4925:植物科学高级投资组合
- PLSCI 4900:关于植物科学经验学习的思考
联系信息
261植物科学
伊斯卡,NY 14853
mjs298[在]cornell.edu
迈克上新闻了
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